Основными направлениями эндокринологического отделения  является диагностика и лечение сахарного диабета. Сахарный диабет является острейшей медико-социальной проблемой и по праву стоит в ряду первых приоритетов национальных систем здравоохранения практически всех стран мира. На базе отделения проводится школа для больных сахарным диабетом типа 1и 2, групповые занятия и индивидуальные беседы по модификации образа жизни и принципах диетотерапии. В отделении также проводится комплексное обследование и лечение заболеваний щитовидной железы (хронический аутоиммунный тиреоидит, многоузловой зоб, гипотиреоз, симптом тиреотоксикоза) .